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jupyter notebook运行python jupyter notebook参数化运行python方式

HackerTom   2021-04-21 我要评论

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(2019.8.14 19:53)吃饭前用这个方法实战了一下,吃完回来一看好像不太行:跑完一组参数之后,到跑下一组参数时好像没有释放之占用的 GPU,于是 notebook 上的结果,后面好几条都报错说 cuda out of memory。

现在改成:将 notebook 中的代码写在一个 python 文件中,然后用命令行运行这个文件,比如:

# autorun.py
import os
# print(os.getcwd())

over = [ # 之前手工改参数跑完的参数组合
 [0, 1, 1], [0, 1, 2], [0, 1, 3],
 [0, 2, 1],
 [1, 0, 1],
 [1, 2, 1]
]

for alpha in range(1, 4, 1):
 for beta in range(3):
  for gamma in range(3):
   if [alpha, beta, gamma] in over:
    continue
   os.system(f'python main.py --alpha {alpha} --beta {beta} --gamma {gamma}')

这里的 main.py 是训练用的主文件。改在 py 里用 os.system 跑,希望跑一组参数之后完会自动释放资源再跑下一组(?)

Notes

有多组参数组合需要尝试,不想每组参数都人工修改 python 代码,再在 notebook 中 %run 它。

python 参数通过的 argparse 接收,在 notebook 中写个多重循环遍历参数组合传给 python 程序自动运行。

记录一个简例。

Codes

test_dir
|- test.py
|- test.ipynb

in py file

# test.py
import argparse

parser = argparse.ArgumentParser()
parser.add_argument('--number', type=int, default=0, help='number')
parser.add_argument('--string', type=str, default='abc', help='string')
args = parser.parse_args()

print('number:', args.number, type(args.number))
print('string:', args.string, type(args.string))

in notebook

注意传参数时 $ 的使用

# test.ipynb
for i in range(3):
 for s in ('a', 'b', 'c'):
  %run test.py --number $i --string $s

补充知识:Jupyter Notebook出现kernel error FileNotFoundError: [WinError 2] 系统找不到指定的文件

Jupyter Notebook出现kernel error

conda create -n py36 --clone root

当时用Anaconda克隆本地的环境root到自己创建的py36环境,由于克隆完成后我又更改了虚拟环境名称,所以导致启动

jupyter notebook 进入文件是不能找到连接文件。

File”//anaconda/lib/python2.7/site-packages/jupyter_client/manager.py”, line 190, in _launch_kernel
return launch_kernel(kernel_cmd, **kw)
File “//anaconda/lib/python2.7/site-packages/jupyter_client/launcher.py”, line 123, in launch_kernel
proc = Popen(cmd, **kwargs)
File “//anaconda/lib/python2.7/subprocess.py”, line 710, in init
errread, errwrite)
File “//anaconda/lib/python2.7/subprocess.py”, line 1335, in _execute_child
raise child_exception
OSError: [Errno 2] No such file or director

解决办法

首先在cmd 使用jupyter kernelspec list查看安装的内核和位置

进入安装内核目录打开kernel.jason文件,查看Python编译器的路径是否正确

如果不正确python -m ipykernel install --user重新安装内核,如果有多个内核,如果你使用conda create -n python2 python=2,为Python2.7设置conda变量,那么在anacoda下使用activate pyhton2切换python环境,重新使用python -m ipykernel install --user安装内核.(通用情况)

或者直接进入kernel.json里更改py36(这是属于我的情况)

重启jupyter notebook即可。

以上这篇jupyter notebook参数化运行python方式就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持。


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